Isso pode ajudá-lo, apesar de eu professar não ser um especialista em MBR, TrueCrypt etc.: link
EDIT: seguindo o comentário da Web-E, este link se refere ao uso de TestDisk para reconstruir a tabela de partições:
"TestDisk (http://www.cgsecurity.org/wiki/TestDisk) pode ser usado para reconstruir MBR / partições (disponível em SystemRescueCd (http://www.sysresccd.org/Main_Page), que parece ser uma boa distro para o resgate do sistema.) "