Recoll é provavelmente o mais versátil no momento. Mas a GUI não é legal. Se você tiver algumas habilidades, acho que o desenvolvedor ficaria feliz por qualquer ajuda .
O Tracker é uma alternativa, mas parece que não há atualizações recentes.
DocFetcher parece ser bom também, melhor GUI. Mas é apenas para documentos, não imagens, músicas, e-mails, ...
A partir de 14 de setembro de 2011, o Google Desktop não estará mais disponível para download e as instalações existentes não serão atualizadas para incluir novos recursos ou Conserta. Por que isso?