Opção 1
Salve o arquivo: link
Mais tarde edite seu ~/.local/share/applications/libreoffice-calc.desktop
.
Encontre a linha com:
Icon=libreoffice-calc
E mude para o seu arquivo salvo em:
Icon=*path-you-have-saved-it*
Opção 2
Localize o ícone do arquivo no seu sistema usando a opção de pesquisa. No meu caso é como:
/usr/share/icons/Humanity/mimes/256/libreoffice-oasis-spreadsheet.svg
para que sua linha pareça:
Icon=/usr/share/icons/Humanity/mimes/256/libreoffice-oasis-spreadsheet.svg