Primeiro, você fez três perguntas em vez de uma. Por favor, crie questões separadas no futuro. Além disso, ajudará você a obter melhores respostas se adicionar mais informações às suas perguntas. Agora, para responder às suas perguntas,
O que levou todos os 24 GB?
Você afirmou na pergunta que alocou 25 GB para o Ubuntu. Tão bem, lá vai você.
Como adiciono mais espaço à minha pasta pessoal?
Já existem algumas perguntas no site semelhantes a isso, você pode dar uma olhada em Como posso adicionar mais espaço em disco ao meu diretório pessoal?
Por que o Disk Usage Analyzer mostra que há 136,7 GB no meu sistema de arquivos?
O Disk Usage Analyzer está mostrando todo o disco rígido. Tudo quando montado no Linux cai sob uma única raiz em uma estrutura de árvore. Por isso, informa a você que o sistema de arquivos inteiro é de 136,7 GB de tamanho. Além disso, este é o analisador de disco uso , você teria informações melhores sobre o tamanho ocupado por suas partições e tudo com uma ferramenta como o Utilitário de Disco ou gparted . Anexei uma imagem abaixo para mostrar o que quero dizer.