Sim, é uma mistura ruim. O Cubo da Área de Trabalho não é suportado no Unity. Mas se você realmente quiser, tente este link
Eu tenho usado o Compiz Fusion no ambiente GNOME de forma feliz com o 10.10 Maverick Meerkat, mas quando o 11.04 Natty Narwhal apareceu, ele começou a me dar problemas com as janelas faltando uma barra de título. Eu finalmente consegui os efeitos funcionarem e as barras de título de volta, ao custo de:
Não sendo possível alternar entre espaços de trabalho no Alternador de espaço de trabalho
Janelas não quebráveis, mesmo com o método Alt-drag
Eu verifiquei on-line e nada parece me dar uma resposta relevante. Eu perguntei no #ubuntu no IRC, e um usuário sugere que pode ser um bug com a placa nVidia. (Eu suponho que seria o driver nVidia que eu usei com 10.10 com os gráficos integrados da Intel).
Alguém tem alguma opinião sobre como lidar com esse problema? Eu poderia suportar com isso (já que estou usando o Metacity). Se não houver um caminho absoluto, meu último recurso seria fazer o downgrade para 10,10.