Estou assumindo que você está falando sobre dados no userspace (essencialmente coisas que vivem abaixo de / home / x3oo). Você provavelmente evitará sincronizar tudo: não há muito sentido em arrastar arquivos de cache por aí. Então, como as pessoas comentaram, você precisa descobrir quais arquivos deseja sincronizar.
Se for apenas sobre o histórico do navegador do Firefox, senhas, guias abertas, etc., você deve analisar a sincronização do firefox . Como você indica que está desconfortável com o armazenamento na nuvem, também pode considerar o Unison do Sincronizador de Arquivos mais geral. Ele fará a maior parte do que você precisa.
O Unison pode ser configurado para ser executado automaticamente, em determinados diretórios, excluir determinados arquivos, manter algumas cópias de segurança e lavar sua roupa. Se você achar que o uníssono funciona, volte com perguntas sobre isso para sua situação em particular.