Perguntas sobre 'awk'

awk é uma linguagem de programação interpretada para fins especiais para extração e relatório de dados.
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Localiza elementos comuns em uma determinada coluna a partir de dois arquivos e gera os valores das colunas de cada arquivo

Eu tenho dois arquivos com valores separados por tabulações que se parecem com isso: arquivo1: A 1 B 3 C 1 D 4 arquivo2: E 1 B 3 C 2 A 9 Eu gostaria de encontrar linhas entre os arquivos 1 e 2, onde a str...
25.10.2012 / 09:41
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Existem versões do Unix que não possuem awk na instalação padrão?

Existem versões do Unix que não tenham o awk instalado por padrão? Eu estou bem com uma resposta contendo alguma variante do Unix desatualizada que antecede a criação do awk; mas idealmente preferiria algum nicho especializado despojado incor...
09.07.2013 / 22:13
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Como adicionar durações de tempo expressas no formato days-hh: min: ss.nnn?

O formato do arquivo é o seguinte: aaa 1-00:12:43.122 aaa 0-21:14:43.133 bbb 3-11:14:54.433 bbb 2-00:00:10 Os números na segunda coluna são do formato d-hh:mm:ss.nnn . Os últimos três dígitos decimais estão ausentes em alguns casos. Eu...
19.07.2017 / 21:23
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Primeiros dois campos a serem separados por _ e resto dos campos como eles são

#CHROM POS REF ALT ../S101_sorted.bam ../S102_sorted.bam ../S105_sorted.bam ../S107_sorted.bam ../S113_sorted.bam ../S114_sorted.bam ../S115_sorted.bam ../S Aradu.A01 296611 T C...
12.01.2017 / 20:51
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Contando o número de linhas com um número maior que 100

Eu tenho um arquivo com muitos números (somente números e cada número está em uma linha). Eu quero descobrir o número de linhas em que o número é maior que 100 (ou, na verdade, qualquer outra coisa). Como eu posso fazer isso?     
26.09.2016 / 00:31
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string de awk corresponde de 2 colunas

Eu tenho um arquivo (arquivo 1) que lê algo assim: 2 test1 3 test2 2 test3 1 test1 4 test2 E há um arquivo mestre (arquivo2): 2 test1 3 test1 4 test1 2 test2 3 test2 4 test2 5 test2 ... Eu quero imprimir tod...
23.03.2017 / 14:41
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calcula a soma dos quadrados usando o shell script em perl / awk

Eu tenho 2 arquivos como abaixo. file1 0.34 0.27 0.32 file2 0.15 0.21 0.15 Agora, gostaria de calcular a soma dos quadrados entre cada coluna. Por exemplo, [(0.34 - 0.15)^2 + (0.27 - 0.21)^2 + (0.32 - 0.15)^2 ] / 3 On...
30.06.2014 / 22:28
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Mesclar vários arquivos com join

Existe alguma solução alternativa para juntar vários arquivos de uma só vez com base na primeira coluna? Normalmente, eu faria:   join File1 File2 > File1+File2 e File1+File2 File3 > final_output Arquivos de exemplo: Arquivo1:...
12.05.2017 / 20:28
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valida o conteúdo do arquivo com expressões regulares bash

Como validar o seguinte conteúdo de arquivo? Isso deve incluir um número inteiro / flutuante único por expressão regular bash ou qualquer outra idéia com awk / sed. exemplo: cat /var/VERSION/Version_F35_project_usa 2.8     
14.08.2017 / 15:08
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Contando um caractere consecutivo específico com sua posição e comprimento de ocorrência

Eu tenho um arquivo de seqüência e quero contar o caractere consecutivo "N" com sua posição de ocorrência e o comprimento Digamos que eu tenha um arquivo chamado mySequence.fasta assim: >sequence-1 ATCGCTAGCATNNNNNNNNNNNNNNCTAGCATCATGCN...
31.08.2017 / 06:06