Eu preciso adicionar uma coluna no arquivo CSV de uma matriz usando o awk.
Por exemplo,
input.csv
a,10
b,11
array = (100 200)
output.csv deve ser parecido com
a,10,100
b,11,200
Eu tentei este comando mas não funci...
Eu tenho um arquivo CSV e quero ter várias verificações para recuperar os dados do arquivo CSV. Eu tenho as seguintes condições que precisam ser atendidas e estou tentando usar o awk em um shell script para preencher estas condições:
if ( Col...
Eu tenho um arquivo como este
>chr1
ACGTGGC
TGCCGTT
ATCCTTG
>chr2
ACTTTTA
CTCATAA
Eu quero converter o seq em uma string. Esta deve ser a saída:
>chr1
ACGTGGCTGCCGTTATCCTTG
>chr2
ACTTTTACTCATAA
Como posso fazer isso usa...
Eu tenho muitos arquivos e preciso mesclar strings entre eles por grupos de três arquivos. Cada arquivo tem ~ 100-500 linhas e o arquivo resultante é ~ 100-200Mb.
O gerador de palavras-chave ppc faz a mesma coisa, mas é muito lento; depois de...
Eu tenho um arquivo YAML que inclui uma estrofe:
admin::common::passwords:
alice:
password: '$6$oTQhLvN/4VFJPscD$8LYwUMSFi'
bob:
password: '$6$JKOtLF0wHeZfIskt$W/M5.ugDS'
Se a variável de shell $ ACCOUNT contiver o nome da con...
Então eu tenho arquivos como este, mas para centenas de genes diferentes por arquivo.
>lcl|accession_cds_proteinaccession [gene=dnaA] [protein=description] [protein_id=accession] [location=location]
ATGTCGGAAAAAGAAATTTGGGAAAAAGTGCTTGAAATTG...
Este deve ser um problema comum, mas não consegui encontrar uma solução.
Eu tenho vários arquivos que têm diferentes conjuntos de colunas que são completamente em branco (para todas as linhas, exceto cabeçalho), como posso excluir essas colunas...
Por exemplo, preciso alterar um " para a palavra quote em
para alterar
a string with a " at some point
em
a string with a quote at some point
Eu tentei:
$ echo 'a string with a " at some point' | awk 'sub(",quote)'
awk:...
Eu quero inserir uma linha após a linha correspondente no arquivo sshd que está presente dentro do diretório pam.d
Por exemplo deve procurar por essa linha
account required pam_nologin.so
e deve inserir uma linha
account r...
Considere um arquivo com key=value pares e cada key é opcionalmente uma concatenação de vários key s. Em outras palavras, muitos key s podem mapear para um value . A razão por trás disso é que cada key é uma palavra relativament...