Perguntas sobre 'awk'

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awk é uma linguagem de programação interpretada para fins especiais para extração e relatório de dados.
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Como executar comandos bash de dentro do awk?

Existe alguma maneira de executar comandos bash de dentro do awk? Eu quero usar o comando 'read' dentro do awk, mas não está funcionando. Existe alguma solução alternativa?     
06.05.2018 / 12:48
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Corresponder início das linhas [fechado]

Eu tenho um arquivo com milhares de linhas, assim: C509.TCGA-78-7159-10A-01D-2036-08.1-C509.TCGA-78-7159-01A-11D-2036-08.1 DNAH7 0 1 1 0 1 1 C509.TCGA-78-7159-10A-01D-2036-08.1-C509.TCGA-78-7159-01A-11D-2036-08.1 IRF5 0 1 1 0 1 1 C509.TCGA...
15.05.2018 / 11:55
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Como obter as linhas que têm maior comprimento entre todas as linhas no arquivo usando o comando awk [duplicate]

Eu quero aquela linha do arquivo que tem maior comprimento entre todas as linhas usando o comando awk .     
28.04.2018 / 14:25
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Adicionando uma nova coluna no arquivo1 que gera uma string em um arquivo de arquivo de referência2 que corresponde ao valor de outra coluna no arquivo1

file1.txt (delimitador de tabulação, com a segunda coluna contendo uma string com espaços): A Golden fog B Vibrant rainbow and sunny C Jumping, bold, and bright D Chilly/cold/brisk air arquivo2.txt (delimitador de tabulação): D...
02.05.2018 / 22:33
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Unindo dois arquivos em um campo

Eu preciso comparar dois arquivos e, com base na comparação, preciso adicionar uma nova coluna no primeiro arquivo. A coluna C é a chave principal . A,B,C,D 1,1990,I001,2473264 2,1991,I002,2473265 3,1992,I004,2473266 4,1993,6050,912432 5,199...
21.04.2018 / 01:30
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Como remover o caractere de nova linha dentro de uma coluna em um arquivo tsv?

Eupreciso"Isso contém nova linha" em uma linha, a nova linha da coluna2 e a coluna4 precisam ser removidas. Nota: Para sua compreensão, os dados que eu enviar uma imagem, se você quiser, vou fazer o upload do conteúdo de texto "column1"...
04.04.2018 / 13:04
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Calcula a diferença de DateTime entre dados de dois arquivos

Eu tenho dois arquivos File1 & Arquivo2 e Arquivo1 possuem dados como "Start Date & Time" = 1804030000 e File2 possuem dados como "End Date & Time" = 1804030400 Ambos os arquivos têm a mesma quantidade de linhas que são...
06.04.2018 / 04:33
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awk- Combina 2 arquivos .csv baseados em uma coluna correspondente

Eu tenho dois arquivos .csv (separados por vírgulas) com muitas linhas. Abaixo estão as entradas de amostra desses dois arquivos: n.csv: X,I180,10.5.5.180,,833-006366,00,N-D,,,5.2,A52.604,5.2.02,,,,,,,8471 FX,,,,, f.csv: X,3FE,1,I180,,...
06.04.2018 / 11:24
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Unindo dois arquivos com base em duas colunas-chave awk

Estou tentando mesclar dois arquivos grandes com base em duas colunas principais (Cromossomo e Posição) e descobri que a maneira mais eficiente parece ser awk . Uma amostra de como meus arquivos se parecem é: file1.txt Gene_ID Chromosome...
19.03.2018 / 15:26
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lista de filtros de duplicados parciais por condição (s)

Eu tenho uma lista de registros duplicados parciais. Cada registro único é identificado por seus primeiros 5 campos, no entanto, cada registro possui mais de um "recurso" associado a ele, definido pelo conteúdo dos 4 campos subseqüentes. Existe...
16.03.2018 / 10:26