Perguntas sobre 'mpi'

MPI é a Message Passing Interface, uma biblioteca para programação paralela de memória distribuída e o método padrão de fato para usar clusters de memória distribuída para computação técnica de alto desempenho. Perguntas sobre o uso de MPI para programação paralela estão sob esta tag; perguntas sobre, por exemplo, problemas de instalação com implementações de MPI são melhor marcadas com a tag específica de implementação apropriada, por exemplo, MPICH ou OpenMPI.
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Por que recebi o erro: 'erro ao carregar bibliotecas compartilhadas: libmpich.so.3'?

Eu instalei o mpich-3.0.4 não em um local padrão. Eu o instalei com base na orientação do instalador do mpich . No entanto, quando tento executar: mpiexec -n 4 -f machinefile ./mpich-3.0.4/examples/cpi Isso me dá um erro, que é: ./...
07.02.2014 / 18:22
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Sistema de arquivos paralelos vs distribuídos versus tradicionais

Estou tentando entender as diferenças entre esses três sistemas de arquivos em um nível muito básico. FS distribuído: HDFS FS Paralelo: Lustre FS tradicional: ext4 / ext3 / NTFS / FAT etc. Eu quero saber quais são as diferenças concei...
15.07.2015 / 08:18
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mpirun com ssh e X11

Atualmente, estamos tentando escrever um programa que usa o mpirun para iniciar vários clientes X11. Se os programas forem somente texto, usando o seguinte comando, podemos executar proceses em uma lista de computadores: mpirun -np 4 --hostfi...
24.01.2013 / 10:44
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Por que 'make' reclama de uma regra ausente quando tento criar um programa a partir do código-fonte?

Eu sou um novato em Linux e estou tentando compilar um software científico chamado DL_POLY_Classic . Eu baixei o arquivo zip dl_class_1.6.tar.gz e o descompactei usando o comando tar xvzf dl_class_1.6.tar.gz . Dá-me uma série de pastas cont...
10.08.2011 / 23:29
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Faz diferença (por exemplo, performance-wise) se eu executar um comando de um script bash (vs a linha de comando)?

Existe alguma diferença entre o seguinte (por exemplo, desempenho-wise): $ make && cp bin/myexecutable inputfile.txt $workdir && cd $workdir $ <series of sed commands to modify inputfile.txt> $ mpirun -n 12 ./myexecutabl...
27.03.2015 / 07:15
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Como executar o Abinit via MPI?

Estou tentando executar Abinit em paralelo, já que no modo sequencial leva muito tempo. Eu segui todos os passos nos abinit tutoriais para executá-lo em paralelo, e eles dizem para usar o OpenMPI, mas eu não conseguia fazê-lo funcionar (ele ap...
28.10.2011 / 18:17
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SSH / OpenMPI: Permissão negada com mpirun mas boa com ssh

Estou tentando configurar um cluster de quatro nós (todos executando o Fedora 22) com o OpenMPI. No nó principal, criei uma chave sem senha (~ / .ssh / id_dsa) e copiei ~ / .ssh / id_dsa.pub para cada um dos três nós escravos '~ / .ssh / auth...
07.09.2015 / 23:18
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mpi.h não encontrado

Eu tentei compilar o programa Hello World em C, dentro do Eclipse PTP, mas ele me deu um erro relacionado a mpi.h . Incluí /usr/local/include e /usr/local/lib em meus caminhos e também tentei executar uma pesquisa com find / -name mp...
21.10.2015 / 16:40
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Usando MPI com um script .sh?

Eu tenho um script runPR.sh como abaixo DIR=/directory/buildagain/bin/Project FILELIST=$1 while read FILE do echo "Processing ${FILE}..." ./makeInp.sh ${FILE} ${FILE} >INP/${FILE}.inp ${DIR} -PR INP/${FILE}.inp done...
12.05.2015 / 00:33
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mpd daemon terminando prematuramente os trabalhos

Eu estou um pouco fora da minha profundidade aqui, então fique comigo. Eu estou tentando configurar o mpirun e o mpiexec para executar o software chamado Materials Studio em um cluster de 1 nó, 2 processadores e 12 núcleos. O esquema de submissã...
08.06.2013 / 15:37