Esta solução funciona para mim, espero que faça por você.
- clique para abrir o diretório na unidade que você deseja duplicar.
- vá até a pasta wineprefix
- copiar pastas na pasta wineprefix
- depois de copiar é feito renomear nova pasta
- sair e abrir o playonlinux
- inicia a aplicação a partir da nova unidade
infelizmente o cofre do playonlinux não está funcionando, não existe mais, então você pode arquivar a nova pasta com 7z ou algum software de compressão