É possível recuperar as configurações do touchpad e do mouse no seu painel de controle.
Você pode simplesmente instalá-lo a partir do gerenciador de pacotes synaptic ou usando o seguinte comando apt
sudo apt-get install touchpad-indicator
Se você estiver enfrentando o problema com as configurações, basta remover o arquivo de configurações do mouse e do touchpad com o seguinte comando
rm -fr ~/.gconf/desktop/gnome/peripherals/mouse
Espero que isso ajude você a resolver seus problemas.