As únicas alternativas que consigo pensar envolvem a mudança de compositor.
Antes de ir mais longe nessa rota, você precisa entender que o Unity (o ambiente de desktop com o qual o Ubuntu padrão vem) depende completamente do Compiz. Se você usa outro compositor, precisa de outro ambiente de área de trabalho.
Supondo que você queira que eu continue, o que estamos procurando agora é um ambiente de desktop substituto. Eles são todos substancialmente diferentes para Unity, então eu não posso dizer o que você deseja. Eu uso o KDE, como o Gnome e uso o XFCE em hardware de baixo custo. Existem muitas, muitas escolhas.
Esta questão vai longe para detalhar alguns deles: