Você não deve se preocupar muito com vírus no Linux. No entanto, você ainda deve ter cuidado em sites fraudulentos que roubam informações e tal.
Se você realmente precisa ser mais seguro, basta instalar um software antivírus. O Clam AV Virus Scaner é encontrado no Ubuntu Software Center.
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Os vírus também são mantidos fora do Ubuntu usando um repositório central de software, de modo que o software é verificado por estar livre de vírus. Esse é um bom recurso de segurança, a menos que você use repositórios de software de outras pessoas. Você deve sempre verificar se eles são confiáveis.
Os bugs de segurança também são consertados muito rapidamente, porque muitas pessoas conseguem consertar e consertá-los, devido ao Open Source Software.