Abra o Terminal e execute
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock dock-fixed false
Em seguida, execute
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock autohide true
Além disso, você pode ativar / desativar o "intellihide" (janelas do dock dodges) por
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock intellihide true/false
e defina o modo intellihide por
gsettings set org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock intellihide-mode 'OPTION'
Para obter as opções do modo intellihide disponíveis, execute
gsettings range org.gnome.shell.extensions.dash-to-dock intellihide-mode