Você não precisa se preocupar em modificar o initrd dentro do container, a menos que você esteja dando acesso ao container para modificar o initrd explicitamente. Basta instalar o pacote e ele deve funcionar bem.
Não existe "script" no .deb que descreva onde instalar os arquivos ou como. O tarball de conteúdo é simplesmente descompactado no diretório raiz. Os scripts que atualizam o initrd são provavelmente postinst e prerm ou postrm no pacote.