(por favor, note que esta resposta é a melhor suposição, então tome-a com um grão de sal) Você poderia inicializar a partir de um Ubuntu USB diferente, com o destino USB também conectado, mas vazio. Você precisaria criar partições personalizadas usando o instalador ou, se reconhecer o USB como um destino para a instalação, basta escolher o USB. Depois de instalar no USB, você precisaria executar as etapas normais de inicialização de um USB para usá-lo.