Uma maneira com sed
sed '/\./!d' file
-
/\./corresponde ao ponto literal (com escape de\porque senão.corresponde a qualquer caractere) -
!dexclui tudo, exceto o padrão correspondente
Se você quiser editar o arquivo, adicione -i ao comando após o teste. (Você também pode adicionar .bak ao -i flag sed -i.bak ... para criar um backup local do arquivo.)
sed -i '/\./!d' file