Não há nada a ver com o Ubuntu. No momento da instalação, você pode formatar seu disco a partir da configuração do Windows.
Se você estiver usando o disco do Windows,
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Abra o BIOS.
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Altere a prioridade de inicialização para inicializar a partir do disco ótico primeiro.
Se você estiver usando a instalação USB do Windows
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Abra o BIOS com o dispositivo conectado.
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Altere a prioridade de inicialização para inicializar a partir do USB.
O seu USB pode ser detectado como HDD, apenas neste caso, na prioridade de inicialização, selecione HDD como primeiro. Em seguida, na ordem HDD, altere a ordem para listar o USB antes do disco rígido. Você deve ser capaz de inicializar.
Se tiver certeza, você está inicializando da mídia correta, a configuração do Windows ainda não inicia, então o disco está corrompido ou não é inicializável.