EDIT: É normal encontrar arquivos infectados no aplicativo baixado, pois eles os colocam lá para os arquivos de teste que você pode testar.
Acabei de atualizar o meu para 0.99.0 com um pouco de configuração para a nova versão.
Primeiro, eu fiz o download da versão 0.99.0 de aqui .
Foi para a pasta "Downloads"
cd ~/Downloads
depois correu
tar zxvf clamav-0.99.tar.gz
para extrair todos os arquivos. Fui para a pasta extraída
cd clamav-0.99/
Tive que instalar a parte do openssl
sudo apt-get install libssl-dev
Em seguida, correu
./configure
make
sudo make install
Depois de instalado, tive um problema com o freshclam
updater. Eu tive que seguir uma resposta que escrevi antes para corrigir o clamav-freshclam
updater.
terrance@DV7-UBUNTU:~$ clamscan --version
ClamAV 0.99
Espero que isso ajude!