Não é apenas possível instalar o Ubuntu em um disco vazio, é até mesmo um pouco mais fácil fazê-lo do que instalá-lo em um disco onde já existem partições.
O Ubuntu OS pode ser instalado em um disco rígido vazio (fresco) ou ele precisa ser instalado em um disco rígido executando o Windows?
Não é apenas possível instalar o Ubuntu em um disco vazio, é até mesmo um pouco mais fácil fazê-lo do que instalá-lo em um disco onde já existem partições.
TL; DR : Sim.
Enquanto o instalador do Inside-Windows chamado Wubi é possivelmente o primeiro método de instalação que um novo usuário descobrirá, isso não significa que essa é a única opção. Na verdade, a maioria dos outros métodos é mais fácil e segura de usar.
O Ubuntu não é dependente do Windows. Eles são sistemas operacionais separados. Ainda assim, eles (e a maioria dos outros sistemas operacionais) podem coexistir sem muitos problemas. Pela natureza da sua pergunta, entendo que sua compreensão do que um sistema operacional realmente é e faz é de certa forma limitada. Você pode querer ler sobre isso .
Por padrão, o Ubuntu é instalado em partições usando o sistema de arquivos EXT4. O Windows usa o sistema de arquivos NTFS. A maioria dos UNIXoids, incluindo o Ubuntu, contém drivers para NTFS e, portanto, pode acessar os arquivos em uma partição do Windows. O Windows, por outro lado, não é fornecido com esses drivers e só pode acessar uma pequena variedade de sistemas de arquivos (NTFS, FAT).
Você pode instalar o Ubuntu em uma partição EXT4 no seu disco rígido, esteja lá um Windows instalado em uma partição NTFS na mesma unidade ou não. Então vários sistemas operacionais podem ser colocados em um disco rígido.
Você pode até fazer o inverso: instale um sistema operacional em várias unidades. Eu não estou falando sobre RAIDs aqui. Por exemplo, meu sistema principal é instalado em um SSD de 256GiB, mas o diretório pessoal do meu usuário é armazenado em um disco rígido muito maior, o que me dá uma boa combinação da velocidade de um SSD e do baixo custo dos HDDs. Outro exemplo poderia ser uma configuração de rede em que o núcleo do sistema é instalado em um compartilhamento de rede e apenas os arquivos dependentes do host são armazenados em partições locais.
Então você vê, a instalação do Ubuntu não depende do estado de um disco rígido ou de vários discos rígidos antes da instalação. Você pode instalar o Ubuntu da maneira que quiser, mas eu recomendo que você se atenha a uma instalação simples em um disco rígido, já que você parece bastante inexperiente com o gerenciamento do sistema de arquivos.
Se a sua verdadeira questão for como instalar o Ubuntu, por favor leia o oficial orientar sobre como fazer isso.