Se você o instalou, poderá desinstalá-lo e suas dependências em apt-get remove --purge samba do que se qualquer uma das dependências for usada também por outro programa, ele não será removido.
O próprio Samba não é apenas para compartilhamento de arquivos, mas também pode ser usado para administração de usuários e grupos. Mas se você não usou isso, não deve haver nenhuma conseqüência em removê-lo novamente.
E eu não sei exatamente, mas acho que o compartilhamento nautilus pode ser apenas algum tipo de plug-in de samba para o navegador de arquivos Nautilus. Então, se você não usa samba, não pode compartilhar arquivos = > você não precisa disso nem