Não tenho experiência em usar o cron, mas você também pode simplesmente escrever um pequeno script Bash que é executado infinitamente em plano de fundo, assim:
#!/bin/bash
while true ; do # starts an infinite loop
YOUR_COMMAND & # runs YOUR_COMMAND in background
your_pid=$! # remembers the PID of YOUR_COMMAND
sleep 2m # pauses the script for 2 minutes
kill $your_pid # kills YOUR_COMMAND by its previously remembered PID
sleep 48m # pauses the script for the remaining 48 minutes
done # defines the end of the loop