Via
mencoder mf://video{000001..100000}.jpeg -mf fps=50 -ovc copy -oac copy output.avi
Mas pode haver um erro, se a lista for muito longa, por exemplo, video{00000000..10000000}.jpg
argument list too long: touch
Portanto, é melhor criar uma lista classificada
find . -type f -name 'video*.jpeg' | sort -V > list
e use a lista
mencoder mf://@list -mf fps=50 -ovc copy -oac copy output.avi