Eu tive o mesmo problema. Não sei bem por que exatamente, mas se você salvar a senha do eduroams para se conectar automaticamente, ela será salva no Chaveiro Padrão (diferente de todas as outras redes que uso, mas eduroam tem segurança corporativa WPA2, talvez por isso ...)
Você pode resolver seu problema configurando o keyring Deafult como pwd para "". Para fazer isso, abra as senhas e chaves do aplicativo (encontradas naquela coisa no canto superior esquerdo da tela), clique com o botão direito do mouse na pasta "Keyring padrão" (guia "Senhas"), Alterar senha. Coloque seu pwd anterior, continue e continue. Feito, você se conectará ao eduroam sem aviso prévio.
EDITAR:
procure por "Segredo de rede para eduroam / 802-1x / senha" em qualquer pasta na guia Senhas, por exemplo, na pasta Login. É importante alterar a senha da pasta Login para a string vazia, como está aqui:
Observe a última linha do artigo: Para login automático, defina pwd para none.