Parece que outras pessoas com o Saitek Elcipse 2 observaram e relataram problemas semelhantes em 2011, onde as teclas especiais disparam um evento de mouse. Eu não encontrei nenhuma evidência de uma resolução. Um tópico no UbuntuForums documenta o problema e aponta uma solução alternativa:
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Um relatório de erros no Launchpad confirma o problema para Maverick e Natty, mas com base em sua experiência, deve haver uma regressão no Precise também.
Você deve reportar o bug e, enquanto isso, você pode tentar a solução alternativa acima. Não é uma correção, mas esperamos que uma atualização futura resolva o problema.