dmraid
deve ser capaz de fazer isso. O dmraid é o driver para as chamadas "FAKERAID" que o colocam em muitas placas-mãe atualmente, chipsets que descarregam todo o seu trabalho na CPU.
Eu não posso garantir que funcionará. Você precisará de um chipset dmraid suportado, alguns discos e um sistema de arquivos multiplataforma para testá-lo ... E eu sugiro seriamente que você teste antes de investir qualquer dado na configuração.
No que diz respeito aos sistemas de arquivos, o suporte NTFS no Ubuntu é muito melhor que o suporte ext- n no Windows. Pelo menos foi a última vez que verifiquei.