Não. Infelizmente não é. Como você provavelmente já viu, o Ubuntu One não está listado nos protocolos suportados no menu suspenso de armazenamento externo em seu ambiente Owncloud.
Na verdade, o protocolo usado para o U1 não é um protocolo padrão (mas o Google Drive e o Dropbox também não são padrão). É desenvolvido pela Canonical. É chamado de ubuntuone-storageprotocol. API's para interface com o Ubuntu One estão disponíveis no momento, então não há nada que pare os devs do owncloud para começar a suportar isso. Isso simplesmente não aconteceu (ainda).