O Windows 8 age de maneira diferente do Windows anterior quando você o encerra.
Aqui é um bom artigo sobre a inicialização híbrida e desligar. A grande figura é uma reinicialização é a única maneira de fazer um desligamento completo tradicional sem usar o DOS ou scripts. Se o Windows não se colocar em um estado em que sua partição possa ser acessada (por exemplo, no modo de hibernação, você não poderá acessá-lo), o Ubuntu não poderá montar o Drive. Então você tem que descobrir porque está pendurado neste boot ou desligamento híbrido.
Também encontrei com o Windows 8, e não encontrei a resposta para isso, que quando você altera arquivos na partição NTFS com o Ubuntu, o Windows geralmente não detecta e acha que há erros no sistema de arquivos. Eu posso fazer um arquivo de teste em uma pasta no NTFS, e o Windows 8 não irá detectá-lo. Pior ainda, se eu alterar um arquivo ou mover arquivos, o Windows detectará erros. Cheguei ao ponto em que não farei nenhuma operação de gravação na minha partição NTFS. Eu criei uma partição EXFAT compartilhada que os dois sistemas operacionais usam para compartilhar arquivos. Triste que eu tive que usar isso (e ainda o Windows não verá arquivos criados pelo Linux). A última vez que o Windows "reparou" minha unidade porque o Ubuntu escreveu arquivos para ela, o Windows definiu todas as permissões de pasta para Administrador e não foi possível carregar as configurações do usuário.