O instalador do Wubi atualmente não suporta o Windows 8. A Microsoft alterou o gerenciador de inicialização, portanto, pode levar algum tempo para os desenvolvedores alterarem o instalador do Wubi. Eles certamente aguardarão até que o Windows 8 seja lançado antes de fazer muito com ele.
Por todos os meios, faça uma instalação completa em uma unidade USB, contanto que você possa configurar o BIOS para inicializá-lo. Obviamente, ele será inicializado e executado um pouco mais lentamente do que se estivesse no disco rígido SATA.
Você também pode configurar um sistema de inicialização dupla adequado, mas a instalação redimensionará sua partição do Windows para liberar espaço para o Ubuntu. Eu recomendo strongmente que antes de fazer isso você desfragmente a partição NTFS e execute o chkdisk nela, e faça um backup de todos os seus dados importantes. Redimensionar uma partição e mover os dados nunca é algo que você queira levar de ânimo leve.
No que diz respeito ao tamanho, depende do que você deseja fazer. 16 GB é mais que suficiente para apenas experimentar o Ubuntu e navegar na Internet. Se você deseja instalar muitos programas e ter muitos dados, então 60 + Gb não seria muito irracional (mas está ficando um pouco além do que o Wubi era destinado de qualquer maneira). Se você quiser editar filmes ou copiar sua coleção de DVDs, precisará de centenas de Gigabytes.