Eu resolvi mais ou menos o problema. Não é ideal, mas funciona. Em configurações do CompizConfig, opções gerais - > Key Bindings, existem duas configurações para "Raise Window", controles de mouse e teclado. Eu configurei o controle do mouse para Super + Button1, que não entra em conflito com Alt + Button1 nas opções "Mover Janela". Eu também configurei "Lower Window" para Super + Button2, para operar ortogonalmente clicando na barra de título.
Embora isso não combine aumentar + diminuir como eu estou acostumado, ele permite que eu acesse o aumento / abaixamento enquanto uso o mouse, então é bom o suficiente para os meus propósitos.