O rkhunter acionará um aviso sempre que você adicionar um aplicativo. Neste caso, está ficando chateado com (ironicamente) a ferramenta de segurança unhide.rb .
Quando você instalar o software, você precisará executar sudo rkhunter --propupd para atualizar o rkhunter, para que ele saiba o que você está "okayed".
Dito isso, o rkhunter é em grande parte para servidores, que normalmente não possuem muitas mudanças no sistema além da configuração inicial. Se você quer algo para se proteger contra malware, você pode querer considerar algo como BitDefender ou ClamAV , algo projetado para uso em desktop.
Além disso, você pode estar interessado em esta questão relacionada , que entra em detalhes sobre o Linux e o malware, e porque o Linux é geralmente menos propenso a ser infectado.