Esta é uma limitação inerente do Skype desde o primeiro lançamento depois que a Microsoft comprou o Skype, e eu suspeito que isso foi feito para limitar o número de coisas que eles tinham que programar para um sistema operacional concorrente (ou possivelmente tornar o Windows mais atrativo para o Skype usuários do Linux). O PulseAudio é o único dispositivo de som que o Linux suporta o Skype, e é isso. Eu resolvi esse problema no meu próprio sistema instalando um fio de extensão no conector do alto-falante; Conecto os alto-falantes na maior parte do tempo e mudo para os fones de ouvido quando estou no Skype. Você poderia fazer isso mais facilmente com uma pequena caixa de comutação A / B com conectores e plugues adequados - mas não há como fazer isso em software.