Não. Não há nenhum recurso como este embutido no Unity. Existem três opções alternativas:
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Execute duas sessões X, uma com saída para cada monitor, mas você só pode ter seu teclado e mouse conectados a um xserver e terá que configurar o outro para ser acessado remotamente. Veja Como executar duas sessões X ao mesmo tempo?
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Execute o VirtualBox ou o KVM em tela cheia em um monitor. A velocidade 3D no monitor convidado será reduzida. Você pode evitar isso se tiver duas placas gráficas diferentes e configurar passagem PCI e, em seguida, executar duas VMs convidadas, cada uma conectada diretamente a uma placa gráfica e, portanto, a um monitor. A desvantagem desta abordagem é que, para compartilhar arquivos entre os dois sistemas operacionais, você deve exportar um diretório compartilhado entre eles. A principal desvantagem, porém, é que é difícil de configurar e tem problemas com algum hardware. Veja Como usar NVIDIA GeForce M310 no Ubuntu 12.10 rodando como convidado no Virtualbox? (a resposta não é específica para Nvidia ou Ubuntu 12.10) e também O clube de passagem VGA - você teve sucesso e como?
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Use uma área de trabalho que suporte a atribuição de um espaço de trabalho a um monitor, consulte Switch espaços de trabalho individualmente em cada monitor