Experimente este arquivo do Uninstaller. Pode funcionar. link
E tente usar o "EasyBCD" também.
Eu tentei seguir o guia como mencionado em:
Como faço para desinstalar o Ubuntu Wubi?
mas infelizmente, Não consigo encontrar o Ubuntu Entry nos meus programas add remove, e acho o guia bastante confuso para desinstalação manual.
Por favor, guie.
Meu sistema operacional é o Windows 7 em C: Ubuntu 13.04 está instalado em D:
usando o instalador Wubi.
Atenciosamente