Depois de passar horas e horas tentando consertá-lo e pesquisando, eu reinstalei o sistema operacional do CD de instalação que eu queimei. Acho que demorou apenas 15 minutos.
Então, a lição é manter todos os dados em uma partição separada. Eu provavelmente não preciso de nenhuma atualização, porque o 11.04 funciona bem do jeito que está. O sistema operacional inteiro usa apenas 4 GB, então um SSD de 64 GB com 2 partições funciona muito bem.