Esse risco é mínimo e não é realmente um problema. Se você quiser saber para onde seus pacotes estão indo, eu aconselho o Wireshark.
Em uma nota separada, não use o site da Skype para fazer o download, pois suponho que você esteja usando o 14.04, para conseguir isso. Em vez disso, adicione estas linhas no Terminal:
sudo sh -c 'echo "deb http://archive.canonical.com/ubuntu trusty partner" >> /etc/apt/sources.list.d/canonical_partner.list
%código%
%código%
Isso instalará a versão correta para o Kernel atual.
Para a Ética do Skype, clique aqui link . Para ler mais sobre os riscos.