Boa pergunta!
Toda vez que você inicializa seu computador, o Ubuntu faz uma varredura rápida e automatizada do sistema de arquivos em seu disco rígido ( /dev/sda ) para garantir que tudo esteja OK. A parte clean da mensagem significa que tudo está, de fato, OK e nenhum problema foi encontrado. A menos que esteja causando atrasos indevidos na inicialização, isso não é um problema, e não é nada para se preocupar!