Também tive este problema, mas o fpoehler ( link ) resolveu-o aqui: link .
"
Os temas que funcionam devem ser aqueles que têm o mesmo plano de fundo do painel que as janelas normais do aplicativo. É por isso que o problema não é aparente lá. No entanto, temas mais recentes costumam usar uma cor diferente ou uma imagem de fundo para o painel.
A correção é aplicar as propriedades do painel (cor de fundo ou imagem de fundo) à classe de widget GtkPlug, que não é considerada na maioria dos temas de ações.
Passos:
1) Descubra a cor de fundo do seu painel ou o caminho para sua imagem de fundo (caso ela tenha uma).
Para a cor, o valor hexadecimal é necessário (por exemplo, "# A1B2C3)".
A imagem na maioria dos casos reside em /usr/share/themes/<Your_Theme's_Name>/gtk-2.0/ ou em uma subpasta dele.
Para o tema Radiance, é
/usr/share/themes/Radiance/gtk-2.0/apps/img/panel.png
2) (Caso haja uma imagem de fundo) copie a imagem de fundo para sua pasta pessoal (ou uma subpasta de sua pasta pessoal).
3) Abra (ou crie) o arquivo chamado ".gtkrc-2.0" na sua pasta pessoal.
4) Copie o seguinte no arquivo:
style "GoogleDesktopIconFix" {
# In case your panel has a background image, add this line
bg_pixmap[NORMAL] = "subfolder/panel.png" # replace "panel.png" with the actual file name or (relative) path
#In case your panel has no background image, add this line
bg[NORMAL] = "#000000" # replace "#000000" with your color value
}
class "*oPlug" style "GoogleDesktopIconFix"
5) Abra um terminal e digite
Código:
pkill gnome-panel"
Resultados:
(cor) 
(Antecedentes)
ps .: se não funcionar:
1) Mude a classe "* oPlug" para a classe "GtkPlug"
2) Coloque o caminho "relativo" para o fundo (exemplo: se eu colocar a imagem de fundo em "~ / gdesk / panel.png" eu tive que colocar o caminho "gdesk / panel .png ")