Salve o arquivo .msc
em um compartilhamento de arquivos e apenas chame o UNC.
O que eu fiz foi criar o arquivo .msc
(como respondido acima), mas salvei-o em um recurso de rede. Quando eu vou para o próximo servidor, eu posso ligar para o UNC através do RUN e fazer o gerenciador de certificados do computador local abrir como a conta do computador também. Eu testei através de um par de caixas de IIS diferentes e descobri que era realmente único e conta do computador.
\fileserver\share\certmgr_computeraccount.msc