Existem quebras de linha, no entanto sistemas operacionais diferentes reconhecem seqüências diferentes para quebras de linha.
O Notepad só reconhece CR, LF (0x0d, 0x0a), enquanto outras fontes podem usar somente CR, ou somente LF.
Você não pode fazer o Bloco de notas se comportar de maneira diferente, portanto, sua única opção é garantir que o conteúdo tenha a seqüência correta para o bloco de notas. Note que o notepad é o único editor com essa restrição, então se o seu conteúdo funcionar no Notepad, ele funcionará em qualquer outro lugar.
Uma forma simples de corrigir os feeds de linha é copiar e colar o texto Word, depois novamente no notepad, e os feeds de linha serão "corrigidos" para a sequência CR, LF.