Bem, mais ou menos. O controle da velocidade do ventilador é feito variando a tensão ou através da modulação por largura de pulso (usando uma tensão constante e cortando-a em pulsos para variar a velocidade). Se você está conectado a uma placa-mãe, é o que faz. Se tiver 3 fios, o terceiro fio diz à placa-mãe qual é a velocidade na qual o ventilador está sendo executado. Se você possui um 4º fio, o controle de velocidade do ventilador é feito via PWM, em vez de controle de tensão.
Você pode conectar uma ventoinha de 2 fios a um conector de 3 ou 4 fios (embora perca a velocidade de retorno) e um conector de 3 fios a 4 fios (onde você perde o controle de PWM). Você também pode usar um controlador de ventoinha para controlar as velocidades.
Senão, supondo que a fonte de energia não esteja ciente de que é um ventilador (como seria conectado através do molex, por exemplo), e está em uma voltagem fixa, sim, ela está a todo vapor.