Selecione Editar > Pesquisa avançada
Selecione "Corresponder palavra ou frase exata" e, em seguida, marque a opção "Somente palavras inteiras".
Aparentemente, isso é apenas no Adobe Reader X (desculpe).
No Adobe Reader 9, é Editar > Procura ( Shift + Ctrl + F )
Nãoháumalistasuspensa,masháaopção"Somente palavras inteiras":