você já experimentou uma versão diferente? Eu não tenho nenhum problema em efeitos ubuntu 16.04 vlc 2.2.2 Weatherwax eu tenho que correr bem. Então você pode por favor postar detalhes de vídeo e efeito que você estava tentando. O melhor será se você postar / apontar para um vídeo exato ou uma parte muito pequena do vídeo para que ele possa ser reproduzido.
Para obter informações detalhadas sobre o arquivo de vídeo, experimente esta ferramenta chamada mediainfo com essa opção --fullscan para que possamos descobrir.
mediainfo --fullscan video.mp4
sinta-se à vontade para remover algumas informações particulares.