Basicamente, se você quiser um sistema de ponta, o Linux é uma plataforma melhor, e é bastante estável, até mesmo o Ubuntu Unity ficou muito legal em 13.04, da perspectiva de um cara que usa o spin Unity daquele distro com seu hardware atualmente e realmente gosta disso.
No entanto, o BSD está no jogo há um pouco mais e tem uma comunidade menor, mais madura e unida do que o Linux, e eles enfatizam mais a maturidade e a estabilidade de seu sistema operacional no que diz respeito aos pacotes. a desvantagem do BSD é que é um pouco mais difícil de usar se você está acostumado com alguma forma de Linux, já que você tem que compilar a maioria das coisas nele, mas você pode instalar a partir de pacotes nele também. diferente como em algumas distros, ie. Gentoo ou LFS, você tem que compilar tudo a partir de fontes, em distros como o Arch, você pode compilar a partir do código-fonte ou instalar binários, enquanto distribuições como Ubuntu, Fedora ou Debian obtêm suas coisas principalmente de binários.
No entanto, existem formas de BSD voltadas para desktop, mais notadamente o PC-BSD, que adota uma abordagem semelhante ao Ubuntu, tornando o BSD o mais fácil de usar e o mais acessível possível para pessoas que são novas. para a plataforma
Por fim, é apenas uma questão de preferência, eu prefiro, por exemplo, o Linux para o foco em ter as coisas mais novas, e porque eu estou acostumado com isso mais, especificamente distribuições Ubuntu ou Debian, enquanto outras pode preferir BSD para a estabilidade dos pacotes.