Poucos motivos possivelmente
- cache de gravação / leitura usado no disco
- criptografia como BitLocker ou TrueCrypt
- O Windows pode usar a unidade como um local de armazenamento de arquivo de paginação dinâmico
- um programa malicioso em execução
... ou pode não ser nenhum dos acima.
Você tentou se conectar a outro computador e os resultados são os mesmos?