Não há diferença entre as versões, exceto nos termos de uso, ou seja, quando / onde você pode instalá-lo.
É legal para você comprar uma cópia OEM do Windows, mas elas são efetivamente instalações "únicas", elas moram e morrem no hardware em que estão instaladas, não tenho certeza se isso significa que você pode reativar se o HDD falhar e você substituí-lo mesmo que o sistema seja efetivamente o mesmo ... Alguns fornecedores fornecerão apenas uma cópia OEM com algum tipo de hardware, como uma unidade, mas YMMV.
Obter a versão completa significa que você pode mover sua cópia do Windows para uma nova máquina e reativá-la sem se preocupar, o pior que você precisará fazer é telefonar para a Microsoft e informar que a cópia antiga do Windows desapareceu . Eu diria que, desde que você mantenha a mídia para o Windows Vista, a versão de atualização deve ser a mesma.