Eu assumo que seu sistema de arquivos é HFS + (dado que você está usando Transmit no OSX). HFS + tem 2 sabores, um é sensível a maiúsculas e minúsculas e o outro é insensível a maiúsculas e minúsculas ( ). No entanto, ambos são caso de preservação ( link ). O sabor padrão do HFS + é insensível a maiúsculas e minúsculas. Você pode mudá-lo, mas pode quebrar alguns apps, então não recomendo.
O que isso significa na sua situação, é que o arquivo é criado como "SLIDER.JS" no seu sistema de arquivos. Você pode abri-lo como "slider.js", "Slider.js" e quaisquer outras variações do mesmo. No entanto, quando você o envia usando seu aplicativo, ele provavelmente usa a versão canônica dele (preservação de caso).
Como você mencionou, renomeá-lo (eu suponho do Finder), para "slider2.js" e voltar para "slider.js", garante que o caso preservado esteja agora em minúsculas.