Eu mesmo procurava essa mesma resposta. Eu finalmente encontrei isso em uma lista de FAQs no site do Panic:
Choose Transmit → Preferences → Advanced, then click the Advanced Server Settings button. Then, check the Preserve modification dates option next to the server in question.
No meu caso, não havia configurações do servidor, apenas uma configuração "padrão", mas desde que eu sempre quis preservar as datas de modificação (para sincronizar as alterações em sites de máquinas diferentes), tudo bem para mim. / p>
Espero que isso ajude.