Se você tivesse o XP ou mais tarde, você poderia usar TASKKILL . Isso não no NT embora.
Eu acho que você vai ter que baixar algo para fazer isso. Eu recomendaria pskill da Sysinternals .
Você pode usar isso com um ID de processo ou apenas com um nome de processo. Por exemplo:
pskill notepad.exe
Outra opção é KILL do NT Resource Kit .